بازی عملیات انهدام 3 داستان جنگ‌های نیروهای مقاومت حزب الله لبنان با رژیم صهیونیستی را روایت می‌کند که در مراحلی نیز داستان بازی به دوران هشت سال دفاع مقدس برمی‌گردد و بازیکن را در میان این نبردها قرار می‌دهد. نسبت به دو شماره قبلی گرافیک بازی بهتر شده است.